增值税分公司的收入在总公司缴税存在哪些税务风险呢？

解答：

增值税分公司的收入在总公司缴税可能存在的如下税务风险：

一、虚开发票风险

1、交易主体不一致

若分公司实际提供服务/销售货物，但由总公司开具发票并收款，构成“合同流、发票流、资金流、业务流”四流分离。依据《发票管理办法》规定，此类行为可能被认定为虚开发票，面临行政处罚甚至刑事责任。

2、行业限制例外

仅建筑行业在符合国家税务总局公告2017年第11号的情况下，允许总公司签约、分公司开票。其他行业（如零售、服务业）无此特殊政策，需严格遵循四流一致。

二、进项税额抵扣风险

1、分公司采购业务

若分公司采购货物、服务等，但由总公司签订合同、付款并取得发票，该发票可能因交易主体不符被认定为不合规，导致进项税额无法抵扣，造成企业整体税负增加。

2、总公司代付风险

分公司采购业务需总公司代付款时，若未签订三方代付协议明确资金性质，可能被认定为总公司与供应商的直接交易，导致发票无法在分公司抵扣进项。

三、企业所得税分配争议

总分公司汇总缴纳企业所得税时，增值税收入若错误计入总公司，可能影响分摊比例（收入、工资、资产三因素），导致分支机构所在地税务机关质疑税款分配合理性，引发补税或滞纳金。

四、增值税属地管理风险

1、跨地区业务未预缴

分公司未在当地申报增值税，可能被税务机关视为逃避属地纳税义务，要求补缴税款及滞纳金。例如：总公司统一收款开票，但分公司实际在异地提供服务或销售货物等，未在业务发生地按规定缴纳增值税税款。

2、视同销售风险

总公司向异地分公司调拨货物未开具发票，可能被认定为向分支机构移送货物用于销售，需按市场价视同销售缴纳增值税（同一县市除外）。

五、汇总纳税合规风险

1、未经审批擅自汇总

除铁路、航空等特殊行业外，总分公司需经总分公司共同的税务局批准方可汇总缴纳增值税。未经审批直接汇总，属于程序违规，可能面临处罚。

2、申报数据矛盾

若总公司合并申报分公司的增值税收入，但分公司单独登记为纳税人，可能导致税务系统数据比对异常，触发稽查。

六、建议解决方案

1、业务模式调整

（1）非建筑行业：分公司独立签约、开票、收款、付款，未申请办理增值税汇总缴纳增值税前，按规定申报增值税；总公司与分公司的内部交易需签订协议并开具发票。

（3）建筑行业：按国家税务总局公告2017年第11号执行三方协议，明确分公司为实际履约方。

2、申请汇总纳税资质

符合条件的集团企业可向税务机关申请增值税汇总缴纳资质，统一处理销项与进项。

3、完善内部管理

建立总分机构资金往来台账，通过「内部往来」科目核算交易，留存合同、物流单据等证据链。